ThruPLEX DNA-seq Kit酶试剂盒Takara

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ThruPLEX DNA-seq Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400406 ThruPLEX® DNA-seq 48D Kit 48 Rxns ¥19,372 ThruPLEX DNA-seq Kit ThruPLEX DNA-seq Kit ThruPLEX DNA-seq Kit
Clontech R400407 ThruPLEX® DNA-seq 96D Kit 96 Rxns ¥34,866 ThruPLEX DNA-seq Kit ThruPLEX DNA-seq Kit ThruPLEX DNA-seq Kit
Clontech R400428 ThruPLEX® DNA-seq 12S (48)Kit 48 Rxns ¥19,343 ThruPLEX DNA-seq Kit ThruPLEX DNA-seq Kit ThruPLEX DNA-seq Kit
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Illumina测序文库构建
ThruPLEX® DNA-seq Kit
· 高灵敏度、高性能:以低至50 pg至50 ngDNA为起始材料
· 完整的文库构建试剂:优化的检索引物和接头试剂、酶、缓冲液及无核酸酶水
· 快速简便的工作流程:单管或单孔3步操作,2小时,无需转移操作
· 兼容主流目标区域富集平台:Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ
   及 IDT xGen® Lockdown® probes
 
■ 产品说明:
ThruPLEX DNA-seq Kit 基于新的ThruPLEX 技术,可以低至50 pg的DNA起始构建DNA文库,在提高灵敏度的同时可以构建多达96种检索引物文库。本试剂适用于多种样品来源的片段化DNA样品,基因组DNA或体液样品如游离DNA,FFPE样品来源DNA和cDNA。ThruPLEX DNA-seq Kit 整体流程可以在单管或单孔中进行,约2个小时即可完成,无需纯化或样品转移步骤。试剂盒提供12、48或96种Illumina单端或双端检索引物,该系列引物保存在反应管中(6或12)或预分装密封于条形码标记的微孔板中。ThruPLEX DNA-seq Kit 可以用于DNA-seq,RNA-seq,ChIP-seq,并且可以兼容主流平台实现强有力的目标区域富集。
 
ThruPLEX DNA-seq Kit
图1. ThruPLEX DNA-seq Kit单管操作流程。
 
ThruPLEX DNA-seq Kit
图2. ThruPLEX DNA-seq Kit技术概要。ThruPLEX技术以片段化双链DNA起始(0.05 ng至50 ng)只需3步反应,简单高效。
 
ThruPLEX DNA-seq Kit
图3. ThruPLEX DNA-seq Kit 优于其他NGS文库制备试剂。与其他试剂相比,ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA,构建多样性更好(左图),重复更少(右图)的文库(25 M read pairs)。NGS文库分别采用图示对照gDNA起始量,以相应的文库制备试剂制备,采用MiSeq v3 flow cell测序。
*数据来源于Takara Bio Inc.

 
ThruPLEX DNA-seq Kit
图4. ThruPLEX DNA-seq Kit 减少了GC偏差。以人类基因组相对覆盖度为GC含量(%)的函数(50 ng DNA起始)。(左图)ThruPLEX DNA-seq Kit 在整个范围内都有出色的覆盖。(右图)ThruPLEX DNA-seq Kit (金色)与参试的其他试剂一样好或更好。请注意,在这些图中最理想的覆盖度应该为1。人类基因组中的GC含量分布以红色柱形图表示。
*数据来源于Takara Bio Inc.

 
ThruPLEX DNA-seq Kit
图5. ThruPLEX DNA-seq Kit的起始量更低、范围更广。与其他试剂相比,ThruPLEX DNA-seq Kit的起始量灵敏度是其他试剂的20倍,起始量范围从50 pg至50 ng,无需流程或接头浓度优化,并且包含检索引物和接头。
 
ThruPLEX DNA-seq Kit
图6. ThruPLEX DNA-seq Kit工作流程优势:2小时即可获得高质量NGS文库。ThruPLEX DNA-seq Kit将双链DNA制备成检索引物文库只需3步:末端修复,接头连接,及高保真文库扩增。 简化的工作流程,在单管或单孔中2个小时即可完成,避免样品损失及操作误差。
 
■ 产品组成
· Template Preparation Buffer(Red)
· Template Preparation Enzyme(Red)
· Library Synthesis Buffer(Yellow)
· Library Synthesis Enzyme(Yellow)
· Library Amplification Buffer(Green)
· Library Amplification Enzyme(Green)
· Nuclease-Free Water(Clear)
· Indexing Reagent(Blue)or Indexing Plate
 
■ 保存
-20℃
 
产品详情请点击:ThruPLEX DNA-seq Kit
 

页面更新:2021-06-07 13:04:06

ThruPLEX Plasma-seq Kit酶试剂盒Takara

上海金畔生物科技有限公司代理Takara酶试剂盒全线产品,欢迎访问官网了解更多产品信息。

ThruPLEX Plasma-seq Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格(元) 说明书 数量
Clontech R400490 ThruPLEX® Plasma-seq 12S Kit 12 Rxns ¥6,297 ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit
Clontech R400491 ThruPLEX® Plasma-seq 48S Kit 48 Rxns ¥21,798 ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit
Clontech R400492 ThruPLEX® Plasma-seq 96D Kit 96 Rxns ¥39,157 ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit ThruPLEX Plasma-seq Kit
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高品质血浆来源cell free DNA NGS文库构建试剂
ThruPLEX® Plasma-seq Kit
· 专为cfDNA设计:经过优化的修复及连接试剂
· 高品质NGS文库:在宽广的GC含量范围内,可以达到高检测再现性
· 起始量范围广:<1 ng到30 ng cfDNA量
· 快速简便:无需纯化或样品转移的单管、2小时、3步操作步骤
· 应用领域:液态活检、ctDNA、目标区域测序等领域文库构建
· 兼容自动化平台:Beckman® FXP Workstation
 
■ 产品说明:
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技术,并用于血浆来源cfDNA高品质NGS文库构建。
该试剂专门针对cfDNA进行优化,在保持样本GC代表性的基础上,提升了文库的信息容量。文库构建后可用于CNV分析、全基因组测序分析或是采用一些panel针对目标区域进行捕获富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血浆样品采用ThruPLEX Plasma-seq试剂盒制备文库,能有更好的灵敏度、更准确的基因变异分析结果。与其它液态活检的样品一样,血浆由于其易获得、价值高的特点,深受研究肿瘤学或者孕妇血浆中胎儿游离DNA科研工作者的重视。
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图1. ThruPLEX® 技术概要。ThruPLEX Plasma-seq Kit技术3步反应即可完成针对cell free DNA的建库工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的进行末端修复。通过采用茎环形接头(无单链尾巴)进行高效平端连接,降低了背景。封闭的5’端阻止了接头-接头二聚体形成。随后未使用的接头被降解,进一步降低背景。高保真度扩增的方式完成以上反应,并获得含有illumina index的文库。
(*图片来源于Takara Bio USA,Inc.)
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图2. 高cfDNA文库多样性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit构建的文库,具有高的多样性和低的duplicates和unmapped reads。图中表示cfDNA分别提取于3份血浆样品,文库定量采用Qubit荧光定量。Bioanalyzer测定mononucleosomal DNA在各样品的量分别为0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式测序,且每个文库产生17 M到25 M reads。每个文库在down-sampling数据至17 M reads以后,计算Duplication rates。
(*图片来源于Takara Bio USA,Inc.)
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图3. 优异的靶向测序文库构建能力。图中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit构建的文库通过panel进行高效捕获,对kinome进行深度测序分析以检测突变。3个血浆样品分别起始建库量为5 ng、6.5 ng、10 ng,三次重复。目标区域采用SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel进行捕获,并用Illumina Miseq平台进行测序,平均每个文库获得5 M reads,目标碱基被成功捕获分析。
(*图片来源于Takara Bio USA,Inc.)
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图4. 高重复性的、无偏倚的GC覆盖度。针对人类基因组,ThruPLEX Plasma-seq Kit表现出高再现性、低偏倚GC覆盖度NGS文库构建能力。9次独立的血浆样品文库构建的实验结果表明,ThruPLEX重复性高于其它产品。文库的制备是利用的1 mL血浆来源cfDNA,后续采用illumina NextSeq 500进行测序。作为对比,A公司试剂构建了4份独立血浆样品的文库。
(*图片来源于Takara Bio USA,Inc.)
 
ThruPLEX Plasma-seq Kit
图5. Karolinska协会和CRUK测试的结果。5 ng游离cf DNA采用ThruPLEX Plasma seq Kit进行illumina文库构建。结果表明利用Hiseq平台进行的Low-pass WGS,每个文库能获得接近12.5 M reads。
(*以上数据来源于Karolinska 协会,瑞典)
 
■ 产品组成
· Template Preparation Buffer(Red)
· Template Preparation Enzyme(Red)
· Library Synthesis Buffer(Yellow)
· Library Synthesis Enzyme(Yellow)
· Library Amplification Buffer(Green)
· Library Amplification Enzyme(Green)
· Nuclease-Free Water(Clear)
· Indexing Reagents(Blue)
· Quick Protocol(N/A)
 
■ 保存
-20℃
 
 
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页面更新:2022-09-06 11:03:46