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SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）酶试剂盒Takara

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SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 640103 PrepX™ ILMN Barcodes 1-24 24 barcodes 询价 SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
Clontech 640107 PrepX™ ILMN Barcodes 1-96 96 barcodes 询价 SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
Clontech 640098 PrepX™ PolyA mRNA Isolation Kit 96 samples 询价 SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
Clontech 640101 PrepX™ DNA Library Kit 24 samples 询价 SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
Clontech 640102 PrepX™ DNA Library Kit 96 samples 询价 SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing）
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SMARTer PrepX试剂盒——简单、自动化的NGS文库制备（For Illumina Sequencing）
· 一次性预分装联排管，不同试剂间使用颜色标记区分
· 在有效范围内，无论起始量高低，均能生成重复性好、质量高的NGS文库
· 良好应对各种实验样本通量
 
■ 应用领域
· 一致的DNA-seq、RNA-seq、ChIP-seq文库制备无缝式解决方案
· Illumina测序平台测序文库自动化制备，无需大量繁琐的手动操作
 
■ 产品说明
SMARTer PrepX试剂（Illumina Sequencing） SMARTer PrepX系列试剂盒提供了Illumina测序文库制备必需的每一种试剂。相关试剂已预分装在单次使用的联排管中，并使用不同的颜色区分标记，可以轻松完成SMARTer Apollo系统操作台面布置工作。SMARTer PrepX系列试剂盒和相关程序脚本的设计融入了灵活性，以适应不同样本通量的需求。设置过程十分简单：只需按照图形用户界面的相关提示将试剂放到指定位置，布置好操作台面，点击“Run”即可，无需人员看管。
 
■ 性能表现
样本起始量和样本质量对于任何测序应用来说都需要着重注意。在实验流程中使用过多的样品或得到的产量很低意味着浪费材料、拖延实验进度、糟糕的实验结果、下游测序实验难以开展。SMARTer PrepX试剂盒配合相关程序脚本通过生成一致的、高质量的NGS文库解决这些困扰。在有效的范围内，不再担心样本起始浓度的影响（Table I）。
 
  Table I. 可靠的测序覆盖度和表现
  Input amount   10 ng   100 ng
  Adapter reads (%)   0   0
  Confidently mapped read (%)   96.61   96.43
  Repetitive reads (%)   1.84   1.80
  Low-quality reads (%)   0   0
 
上述实验，使用SMARTer Apollo系统，搭配SMARTer PrepX DNA Library Kit，从10 ng和100 ng E. coli基因组DNA中完成高质量文库制备。获得的文库使用Illumina MiSeq?平台进行测序（2 × 150 bp）。
 
■ 上样量要求
每一种SMARTer PrepX试剂与一个对应不同通量的脚本相兼容，有最小样本上样量的需求。相关总结见Table II。
 
  Table II. SMARTer PrepX kits与SMARTer Apollo预编程脚本不同组合所需样本量
Code No. SMARTer Apollo试剂盒 兼容脚本 脚本通量 最小上样量/样本
640101*  SMARTer PrepX DNA Library Kit PrepX ILMN 8 1-8  1 ng DNA
640102*  SMARTer PrepX DNA Library Kit  PrepX ILMN 32i 4-32  1 ng DNA
640098  SMARTer PrepX PolyA mRNA Isolation Kit, 96 Samples PrepX PolyA 8 or PrepX PolyA 48 1-8
or 6-48 		 100 ng total RNA
 
* Code No.640101提供足够运行24个样本的试剂量，每批次多达8个样本。Code No. 640102提供足够运行96个样本的试剂量，每批次多达32个样本。
 
 
 
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SMARTer Apollo系统专用耗材酶试剂盒Takara

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SMARTer Apollo系统专用耗材
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 640088 Apollo™ 1.1 mL MiniTubes 960 tubes 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640089 Apollo™ 96 Tip Rack Each 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640086 Apollo™ Caps for 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear 125 caps 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640084 Apollo™ Filter Tips 5 racks 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640085 Apollo™ Piercing Tips 1000 tips 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640087 Apollo™ Reservoirs 100 reservoirs 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640082 SMARTer™ Apollo™ 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear 125 strips 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Clontech 640083 SMARTer™ Apollo™ Microtiter Plates 25 plates 询价 SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
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SMARTer Apollo系统相关耗材
 
■ 产品说明
SMARTer Apollo系统专用耗材 我们提供多种SMARTer Apollo系统相关耗材制品，包括储液槽，离心管，管盖，平板，吸头，耗材支架。相关耗材和SMARTer Apollo试剂、程序脚本配合使用，为自动化DNA-seq，RNA-seq，ChIP-seq应用提供完整、易行、一致性良好的文库制备解决方案。
 
■ 产品图片
SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Apollo™ 1.1 ml MiniTubes
 Apollo™ 96 Tip Rack
 
SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Apollo™ Caps for 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear
 Apollo™ Filter Tips
 
SMARTer Apollo系统专用耗材 SMARTer Apollo系统专用耗材
Apollo™ Piercing Tips
 Apollo™ Reservoirs
 
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SMARTer™ Apollo™ 0.2 ml PCR 8-Tube Strips, Clear
 SMARTer™ Apollo™ Microtiter Plates
 
 
 
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634485 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 24 Rxns ￥30,451 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634486 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 48 Rxns ￥47,045 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634487 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 96 Rxns ￥63,820 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Clontech 634488 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian 192 Rxns ￥114,044 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
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带分子标签的微量样本的链特异RNA-Seq分析
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian
· 高灵敏度：可以人、大鼠或小鼠来源的250 pg-10 ng的总RNA或10-1000个细胞起始
· 添加UMI：校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取
· 用途广泛：能分析质量较差的FFPE、LCM以及cfRNA来源的样本
· 操作简便：仅需要7.5小时即可完成文库构建
· 无缝衔接Illumina测序：直接制备多达192种index的Illumina® -ready文库
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian（Pico v3）设计用于从皮克级总RNA(250 pg-10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂盒采用的技术适用于高品质、部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且还添加特别的分子条形码（UMI），从而可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向。
 
本试剂盒采用一体化操作流程，保留了链来源信息，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。整个流程，包括文库构建及纯化仅需约7.5小时。
该试剂盒包含SMARTer RNA Unique Dual Index Kit – 24U (Code No. 634451)。另外也可以与SMARTer RNA Unique Dual Index Kits (Code No. 634452 & 634457，可单独购买）搭配使用，最多可构建多达192种indexes文库。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian技术流程
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
图2. 使用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备文库的结构特征
 
接头序列包含：通过PCR 1反应添加的可以与Illumina流动池结合生成簇的P7、P5序列（P7以淡蓝色表示，P5以红色表示），用于区分单个lane上多个样本的Index序列（Index 1 [i7] 序列连接在P7端，Index 2 [i5]连接在P5端）。并且还包括识别测序引物区域的Read 2（紫色）和 Read 1（绿色）。通过Read 1起始得到的原始RNA的反义链序列，Read 2起始获得的是原始RNA的正义链序列。其中，通过Read 2起始时，前8个碱基是UMI（深紫色），UMI之后的3个碱基（XXX）是Pico v3 Adapter衍生的序列。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
表 1. 不同样本起始量的分析结果。
 
以0.5、1、5和10 ng人肺FFPE组织提取的总RNA起始，采用SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 – Pico Input Mammalian制备RNA-Seq文库（均做两个重复），并使用NextSeq 500进行测序。
 
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
Technote：
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v3 - Pico Input Mammalian
SMARTer Stranded RNA-Seq Pico v3:
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian酶试剂盒Takara

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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635005 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian 12 Rxns ￥15,684 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 635006 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian 48 Rxns ￥46,033 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 635007 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit – Pico Input Mammalian 96 Rxns ￥63,435 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634411 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 12 Rxns ￥12,881 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634412 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 48 Rxns ￥43,794 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634413 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 96 Rxns ￥57,613 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
Clontech 634414 SMARTer® Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 192 Rxns ￥103,664 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input
Mammalian以皮克级总RNA构建Illumina链特性RNA-seq文库
· 皮克级样品起始—可以250 pg-10 ng人，小鼠或大鼠总RNA起始
· 用途广泛—可以不同品质RNA（包括FFPE/LCM样品及游离RNA）制备文库，获得高重复再现数据
· 性能提升-不增加PhiX也可获得较高的簇通过过滤百分比（FP%），识别更多转录本，重复更少
· 保留链来源信息—转录本链来源信息识别准确度高
· 快速，一体化流程—整体流程只需~6 h ，改良了buffer配方，缩短了文库纯化时间
· 无缝衔接Illumina测序—直接制备多达96种index的 Illumina®-ready文库
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian设计用于从皮克级总RNA(250 pg–10 ng)中高效制备Illumina测序文库。本试剂中采用的技术适用于高品质，部分降解及低品质RNA（如来自于FFPE或LCM样品）。本试剂是一体化操作流程，保留了链来源信息，并且不需要下游文库制备，在反转录和PCR扩增过程中就可以添加indexes和接头。升级产品与原有SMARTer 皮克级产品相比，提升了在所有Illumina测序平台的测序性能，并且文库纯化操作更加方便。
核糖体RNA在总RNA中占有很高的比重（~90%）。在制备文库前从总RNA中去除掉这些大量的RNA，有利于降低测序成本，提高统计数据的比对比率。但是在以微量样品起始时，如果一开始就从总RNA中去除rRNA，会造成纯化后的起始样品太少而不能制备高品质测序文库，本试剂采用专有的特异针对哺乳动物rRNA和部分线粒体RNA的探针去除核糖体cDNA（来源于核糖体RNA的cDNA片段）。采用本试剂制备的文库与前代试剂制备的文库接头配置不同，即使是使用基于双通道SBS技术的Illumina平台如NextSeq®， MiniSeq™， 和 HiSeq® 3000/4000测序时，不需要添加大量PhiX也可以获得高比例的簇通过过滤百分比(%PF)。每个run可以获得更多的生物学相关测序reads，这又反过来减少了测序成本。采用Pico v2 Kit同样可以获得更多的特异转录本，更低的rRNA、mtRNA比对率和重复率。此外，Pico v2 Kit包含了一种新的PCR buffer，提高了文库纯化效率。
试剂盒提供12，48，96和192次反应规格。高通量版本试剂 (Code No. 634413,634414) 包含12种反向引物，8种正向引物，最多可以构建96种indexes文库。包括文库构建及纯化的整体流程只需~6 h。
 
不同样品起始量解决方案：
· 10-100 ng 总RNA, 推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian
· 100 ng-1 μg总RNA, 推荐使用SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图1. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian技术流程
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图2. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian提高了通过过滤百分比（FP%）。如图所示，分别采用Pico v1 或Pico v2制备文库并使用NextSeq 500 或 MiniSeq平台测序。图中，蓝色图框表示未过滤（原始）reads的簇密度分布，绿色图框表示通过过滤reads的簇密度分布。 图中显示了通过过滤的reads数（以百万计）和每个run的%PF。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图3. 新的SeqAmp CB PCR buffer利于磁珠-沉淀物形成。Pico v2中的PCR buffer经过重新设计可以更快、更紧密的形成磁珠-沉淀物。经过磁力分离后，在新的SeqAmp CB buffer（右）中的沉淀物比原来PCR buffer（左）中的沉淀物更紧密。紧密的沉淀物比松散的沉淀物更容易干燥，易于重悬。
 
SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
图4. SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 – Pico Input Mammalian 提升了灵敏度和重复再现性。上图为以1 ng和10 ng人肺FFPE来源的总RNA起始，分别采用Pico v1和Pico v2构建文库，NextSeq 500测序数据。Panel A. 以1 ng和10 ng样品起始，分别采用Pico v1和v2构建文库的测序数据。Panel B. 不同样品起始量之间，转录本表达水平的比较分析。
 
Technote：
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
SMARTer Stranded RNA-Seq PICO：
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SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2 - Pico Input Mammalian
 
 
延伸阅读
病原微生物NGS解决方案来了，您准备好项目了吗？
Takara真香推荐—简便准确好用的液态活检解决方案之游离RNA篇
『石以砥焉，化钝为利！』Takara匠心打磨FFPE样本分析利器
 
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页面更新：2020-11-27 10:15:56

SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian酶试剂盒Takara

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SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634873 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian 12 Rxns ￥17,520 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian
Clontech 634874 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian 24 Rxns ￥29,766 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian
Clontech 634876 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian 96 Rxns ￥88,161 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian
Clontech 634877 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian 192 Rxns ￥140,875 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian
Clontech 634878 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian 480 Rxns ￥290,743 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian
Clontech 634875 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian 48 Rxns ￥54,845 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian
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SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit-
HI Mammalian—以高起始量总RNA构建Illumina测序平台链特异性RNA-Seq文库
· 保留链来源信息—转录本链来源识别准确率>99%
· 快速，简便流程-从开始到结束~ 5h
· 起始范围广—适用于人，小鼠或大鼠100 ng-1 μg总RNA
· 适用样品范围广-不同品质RNA，不同重复间均可获得可靠数据。
   RIN (RNA Integrity Number) 值3-10的总RNA均可获得高质量重复数据
· 兼容Illumina测序-构建96 index Illumina测序文库，并保留链来源信息
 
SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian提供了从100 ng–1 μg哺乳动物总RNA构建Illumina index测序文库的快速解决方案。本试剂结合了RiboGone和SMART技术，可以无缝融合rRNA去除和链特异性文库构建过程，整个过程只需约5小时。由于rRNA约占总RNA的90%，在文库构建前高效去除这些高丰度转录本可以降低测序成本，提升数据比对率。核心SMART技术可以在RT和PCR扩增过程中添加index和测序接头，无需下游文库构建，并且可以保留链来源信息。
这些高通量试剂包含12条反向引物和8条正向引物可以生成多至96个独立index文库。整个流程-从rRNA去除到Illumina专用index RNA-Seq文库-只需约5小时。
 
不同样品起始量解决方案：
· 250 pg-10 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 10-100 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian
 
产品详情请点击：SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit - HI Mammalian
 
 

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SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing酶试剂盒Takara

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SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634938 SMARTer® Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 10 Rxns ￥13,566 SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
Clontech 634940 SMARTer® Universal Low Input RNA Kit for Sequencing 25 Rxns ￥29,054 SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
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SMARTer Universal Low Input RNA Kit—
降解样品NGS用 cDNA文库构建
· 灵敏度高，适用微量样品—适用于200 pg 去除rRNA的RNA样品（来自于2-100 ng总RNA）99%
· 从低品质样品中获得有效结果—FFPE样品的理想解决方案
· 高质量RNA-seq数据—在起始量范围内获得一致的 RNA-seq 数据 (200 pg-10 ng)
    ○ 简便-起始到结束不到4小时
    ○ 重复再现性 > 0.98
    ○ ERCC 相关性 > 0.99
    ○ 基因数 > 15,000
· 包括RT和PCR酶的完整试剂盒
· 请参考下表选择合适试剂：
 
cDNA 合成试剂 RNA-Seq 文库制备
SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing (Code Nos. 634938, 634940)   Ion Torrent 或 Illumina 试剂 (不包含)
 
SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing为微量低品质样品，如低RIN值或不含Poly A的mRNA样品提供了一种简便、高效的构建cDNA用于RNA-seq的解决方案，起始量可以低至200 pg去除rRNA的RNA（来自2-100 ng总RNA）。SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing设计专用FFPE或激光捕获样品的RNA-seq，在转录本覆盖度，重复性，比对率和ERCC相关性方面都优于现有方法。采用本试剂制备的cDNA兼容Illumina 和Ion Torrent微量文库制备试剂盒。
对于10-100 ng 总RNA中的rRNA去除，推荐使用 RiboGone – Mammalian kit。
 
其他样品起始量解决方案：
· 250 pg-10 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 100 ng-1 μg总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
 
产品详情请点击：SMARTer Universal Low Input RNA Kit for Sequencing
 
 

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SMARTer Stranded RNA-Seq Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634836 SMARTer® Stranded RNA-Seq Kit 12 Rxns ￥14,891 SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
Clontech 634837 SMARTer® Stranded RNA-Seq Kit 24 Rxns ￥28,073 SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
Clontech 634838 SMARTer® Stranded RNA-Seq Kit 48 Rxns ￥45,293 SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
Clontech 634839 SMARTer® Stranded RNA-Seq Kit 96 Rxns ￥65,759 SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
Clontech 634861 SMARTer® Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian 24 Rxns ￥46,166 SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
Clontech 634862 SMARTer® Stranded RNA-Seq Kit HT 96 Rxns ￥67,118 SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
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SMARTer Stranded RNA-Seq Kits—
Illumina平台链特异性转录组测序文库构建
· 准确-每条转录本的链来源信息的识别准确率>99%
· 灵敏-适用于低至100 pg-100 ng的RNA起始。推荐使用去除rRNA或纯化的Poly（A）RNA
· 兼容Illumina测序-流程中整合了index和Illumina接头
· 简便-起始到结束不到4小时
 
SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian (Code No. 634861) -从总RNA到RNA-seq文库的完整解决方案，适用于大部分人、大鼠或小鼠样品。
SMARTer Stranded RNA-Seq Kit HT(Code No. 634862)-采用Illumina高通量index构建96种index RNA-seq文库。其他SMARTer Stranded RNA-Seq Kit采用12种低通量index。
SMARTer Stranded RNA-Seq Kit 提供了一种构建Illumina链特异性测序文库的解决方案，并且链特异性识别准确率>99%，可以从低至100 pg至100 ng的RNA起始获得可靠数据。SMARTer Stranded RNA-Seq Kit 采用随机引物法适用于原核或真核RNA，推荐使用去除rRNA或poly（A）富集RNA样品。本试剂采用改良的核心SMART技术，可以生成完整转录组文库，包括编码和非编码RNA，同时添加index和接头，无需下游文库构建试剂。采用SMARTer Stranded RNA-Seq Kit不到4小时即可构建适用于Illumina测序的index文库。同时提供SMARTer Stranded RNA-Seq Kit HT，包括8条正向引物和12条反向引物可以生成多至96个独立index文库用于高通量研究。
对于10-100 ng总RNA中的rRNA去除，推荐使用RiboGone – Mammalian kit。 SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – Low Input Mammalian 结合了SMARTer Stranded技术和RiboGone rRNA去除技术，可以实现从总RNA样品起始到RNA-seq文库制备的无缝衔接，5 h内即可完成。
 
不同样品起始量解决方案：
· 250 pg-10 ng总RNA，推荐使用 SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2- Pico Input Mammalian
· 100 ng-1 μg总RNA，推荐使用SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit – HI Mammalian
 
SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
 
 
 
Technote：SMART Stranded Kit
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产品详情请点击：SMARTer Stranded RNA-Seq Kit
 
 

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SMARTer Target RNA Capture for Illumina酶试剂盒Takara

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SMARTer Target RNA Capture for Illumina
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635035 SMARTer® Target RNA Capture for Illumina 12 Rxns ￥17,219 SMARTer Target RNA Capture for Illumina SMARTer Target RNA Capture for Illumina SMARTer Target RNA Capture for Illumina
Clontech 635036 SMARTer® Target RNA Capture for Illumina 48 Rxns ￥48,351 SMARTer Target RNA Capture for Illumina SMARTer Target RNA Capture for Illumina SMARTer Target RNA Capture for Illumina
Clontech 635039 Capture Beads Each ￥10,270 SMARTer Target RNA Capture for Illumina SMARTer Target RNA Capture for Illumina
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靶向RNA-Seq，捕获全长转录本信息—SMARTer Target RNA Capture for Illumina
· 低至10 ng纯化总RNA起始
· 特定富集目标转录本的简便流程
· 以富集的DNA构建Illumina-ready全长文库
· 文库制备中不需要接头连接即可添加测序接头库
 
SMARTer Target RNA Capture for Illumina 是设计用于从富集的总RNA中构建cDNA文库的完整系统。靶向RNA-seq可以克服全转录组扩增（WTA）RNA-seq的多种挑战，提高测序覆盖度及低丰度目标转录本的检测灵敏度。靶向RNA-seq同时也具有节省成本及简化分析的优势。在cDNA合成前富集目标转录本可以捕获那些易丢失转录本或需要很多测序数据才能被检测到的转录本的信息，包括嵌合基因融合，转录异构体，剪接变异体。
SMARTer Target RNA Capture for Illumina的操作流程中，总RNA与使用者设计的生物素标记的DNA探针杂交不到4 h，纯化后采用Capture Beads（链霉亲和素包被的磁珠）捕获。Capture Beads是经过挑选的，具有格外低的蛋白和核酸吸附性，并且不会干扰下游反应，如PCR或反转录，使得靶标样品可以附着在磁珠上直接进行cDNA合成。
基于SMART-Seq v4 Ultra Low Input Kit的灵敏度，本试剂可以富集的转录本获得高质量的全长cDNA。试剂设计用于低至10 ng总RNA起始，我们甚至可以从低至100 pg的总RNA起始获得成功实验，详情请参考Technote。本试剂使用oligo (dT) 引物起始，设计用于高品质样品，不需要额外的rRNA去除试剂或方法，构建适用于Illumina测序平台的测序文库。
 
SMARTer Target RNA Capture for Illumina
图1. SMARTer Target RNA Capture for Illumina操作流程
 
Technote：
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SMARTer RNA Unique Dual Index Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer RNA Unique Dual Index Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634451 SMARTer® RNA Unique Dual Index Kit – 24U 96 Rxns ￥7,589 SMARTer RNA Unique Dual Index Kit SMARTer RNA Unique Dual Index Kit SMARTer RNA Unique Dual Index Kit
Clontech 634452 SMARTer® RNA Unique Dual Index Kit – 96U Set A 384 Rxns ￥23,503 SMARTer RNA Unique Dual Index Kit SMARTer RNA Unique Dual Index Kit SMARTer RNA Unique Dual Index Kit
Clontech 634457 SMARTer® RNA Unique Dual Index Kit – 96U Set B 384 Rxns ￥23,503 SMARTer RNA Unique Dual Index Kit SMARTer RNA Unique Dual Index Kit SMARTer RNA Unique Dual Index Kit
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SMARTer RNA unique dual index kits
– 提供兼容Illumina NGS文库的index
– 最多可用于96个DNA-seq文库
– 尽可能的减少index的交叉污染和扩增造成误差
 
SMARTer RNA unique dual index kits含有PCR引物，可与SMARTer NGS RNA-Seq kits文库制备试剂盒搭配使用，用以构建Illumina测序文库的index引物试剂盒。这些试剂盒包含“IDT for Illumina UD”对应的index引物，用于样本混合测序时的区分。
 
本产品兼容：
· SMARTer Stranded RNA-Seq Kit（Code No. 634836～634839）
· SMARTer Stranded RNA-Seq Kit HT（Code No. 634862）
· SMARTer Stranded Total RNA Sample Prep Kit-Low Input Mammalian（Code No. 634861）
· SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit-Pico Input Mammalian（Code No. 635005～635007）
· SMARTer Stranded Total RNA-Seq Kit v2-Pico Input Mammalian（Code No. 634411～634414）
· SMART-Seq Stranded Kit（Code No. 634442～634444）
· SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina（Code No. 635029～635031）
 
 
 
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SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina酶试剂盒Takara

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SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635029 SMARTer® smRNA-Seq Kit for Illumina 12 Rxns ￥8,777 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
Clontech 635030 SMARTer® smRNA-Seq Kit for Illumina 48 Rxns ￥31,178 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
Clontech 635031 SMARTer® smRNA-Seq Kit for Illumina 96 Rxns ￥55,431 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
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SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina → SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina   SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina → SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
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SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina  
 
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina—高灵敏度，低偏差的小RNA测序
· 分析不同种类的小RNA—适用于15-150 nt 小RNA测序文库构建
· 起始样品灵活—可以 1 ng-2 μg总RNA或富集的小RNA起始
· Illumina-ready 测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和indexes序列
· 快速的单管操作—~3 h即可构建测序文库（不包括检测和PCR后片段筛选过程）
 
发现和分析小非编码RNA(smRNAs)已经成为理解基因表达调控非常重要的一部分。一些熟知的小RNA种类如miRNAs, siRNAs, piRNAs和snoRNAs长度在20到30 nt。 SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina专门设计用于从这些微量小RNA中构建高品质Illumina-ready测序文库。
试剂盒可以直接从1 ng-2 μg总RNA或富集的小RNA样品起始，与SMART-Seq V4 Kit相同，采用了SMART技术和LNA技术，不需要接头连接即可构建测序文库，可以确保多种类小RNA的代表性，并且偏差很小。
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
图1. SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina技术流程
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
图2. SMART法smRNA-seq的准确性
 
SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina
表1. 不同类型，不同起始量的总RNA主要测序数据
 
Technote：
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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2酶试剂盒Takara

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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634478 SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit v2 12 Rxns ￥23,613 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
Clontech 634479 SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit v2 48 Rxns ￥51,657 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
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· 适合不同起始量样本：支持total RNA(10 ng-1 μg外周血淋巴细胞来源或 1 ng-100 ng T细胞来源 total RNA)，或者纯化后完整的T细胞（1,000-10,000个）起始；
· 无需多对引物：每次反应仅需一对引物扩增相应的TCR亚基；
· 更灵敏特异的克隆型分析：优化的cDNA文库构建技术，确保克隆型的可靠分析；
· 添加UMI校正：引入UMI建库，校正PCR偏差及测序错误产生的reads；
· 更可靠的样本-数据拆析结果：整合UDI建库，在高通量型Illumina测序仪上有更好的样本拆析与测序可靠性；
· 更灵活的测序平台选择：可自由选择Miseq平台（分析V(D)J 全长信息），或是其它Illumina平台（分析CDR3区），支持最多192个样本同时测序；
· 完整的流程：搭配特别开发的Cogent NGS Immune Profiler Software*完成测序数据分析；
*科研及盈利机构在用TCRv2建库、测序后，均可免费使用Cogent NGS Immune Profiler Software分析测序数据
 
■ 产品说明
T细胞是获得性免疫反应的重要组成部分，其表面受体蛋白（T cell receptors, TCRs）发挥着识别抗原分子的作用。NGS是解析TCR多样性的主流技术，对揭示个体获得性免疫反应的奥秘提供了宝贵的技术支撑。
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2 (TCRv2)是一款具有更高重复性和特异性的TCR NGS文库构建试剂盒。该试剂盒整合SMART（Switching Mechanism at 5′ end of RNA Template）全长cDNA合成技术与5’RACE技术，可捕获TRA和TRB基因完整的V(D)J可变区，用于后续NGS分析。
TCRv2试剂盒支持不同input量的RNA（RIN≥8，取决于样本类型）或细胞起始，均可获得高品质的测序文库，如外周血淋巴细胞total RNA(10 ng-1 μg)、T细胞total RNA(1 ng-100 ng)，或纯化后完整的T细胞(1,000-10,000个)。文库中可同时包含α链和β链的多样性信息。
同时，TCRv2试剂盒包含UMI（Unique Molecular Identifier），用以去除PCR偏差及测序错误所产生的reads，提供更正确和可靠的结果。
相较于前代产品，TCRv2所建文库支持更多样的测序平台。既支持Miseq平台（分析V(D)J全长信息），也支持其它Illumina平台（分析CDR3区）。 此外，TCRv2试剂盒还整合了UDI（Unique Dual Index），能更正确拆析采用图案化流动槽技术（Patterned flow cell）测序平台（如NovaSeq™ system）的下机数据，同时也支持更多样本同时测序。
特别开发的Cogent NGS Immune Profiler Software，能直接对Illumina测序仪的下机数据进行高品质的TCR profiling分析，包括克隆型的鉴定与计数、V(D)J区域的序列分析。
 
■ 建库原理
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
 
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
 
■ 不同起始量克隆型检测数据
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
图1 不同的RNA或者T细胞起始量，均能获得高灵敏性和重复性的克隆型检测数据
 
Takara科学家以1、10、100 ng 人CD3+ T细胞total RNA和1,000、10,000个CD3+T细胞制备TRA和TRB文库，测序reads用Cogent NGS Immune Profiler软件分析。结果显示，无论采用RNA还是以复杂度较高的T细胞直接起始，TCRv2试剂盒所建文库均能获得良好的克隆型检测数据。
 
■ 灵敏度测试数据
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
图2 Takara科学家向100 ng PBMC RNA样本中掺入不同浓度（10%，1%，0.1%，0.01%，0.001%和0.0001%）的Jurkat T细胞RNA（包含TRBV12-3-TRBJ1-2克隆型）。采用TCRv2试剂盒扩增TRB CDR3区域并制备文库、NextSeq系统测序。测序reads downsample至 2.5M reads。灰色标记的是所混入的Jurkat RNA检出下限，结果显示，在未通过UMI数据校正时，TRBV12-3的检测极限为0.01%，但是在UMI数据校正的情况下，检测极限下探至0.001%！
 
■ 同类产品比较实验
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
图3 为了比较不同TCR分析方法（DNA based VS RNA based）的性能差异，Takara科学家分别以TCRv2（RNA based, 5’RACE）、Company X（RNA based，接头连接法）、Company Y(DNA based, 多重PCR)作为文库构建方案。接着分离了500万个PBMC细胞作为gDNA和RNA的提取材料，并以1.6 μg gDNA和100 ng RNA制备文库，分析TCR a/b文库的克隆型数量。从结果中可以看出，TCRv2文库获得TRA和TRB基因平均4.87万和16.3万个克隆型检测数据，远高于Company X RNA方法及Company Y DNA方法所获得克隆型数量！
*NT Not Tested
数据来源于Takara Bio USA, Inc.
 
SMART Human TCR-Seq v2：
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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit v2
 
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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635016 SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥61,300 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit—
获得TCR-α和TCR-β链V(D)J可变区全长序列
· 完整的 V(D)J序列信息—获得TCR mRNA转录本可变区全长序列
· TCR-alpha 和 TCR-beta—分析TCR2个亚基的多样性，无论是同一实验还是单独实验
· 起始样品灵活—可以10 ng-3 μg 外周血RNA或50-10,000个纯化T细胞起始
· 无需多重PCR—每次反应利用一对引物扩增相应的TCR亚基
· Illumina-ready 测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和index序列
· 灵敏度高—即使是测序深度很低的情况下也可检测低丰度TCR序列
· 出色的重复性—在不同起始量情况下可以获得一致性很好的结果
 
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit给需要开展T细胞受体（TCR）NGS分析的研究者提供了一种新的强大的解决方案。试剂盒采用类似于5’RACE的方法，可以人血液RNA(10 ng-3 μg)或完整淋巴细胞(50-10,000 个纯化T细胞)起始，捕获TCR V(D)J完整可变区域。顾名思义，本试剂可以在同一实验或单独实验中获得TCR-alpha和TCR-beta链多样性数据。与采用多重PCR方法研究TCR多样性不同，每轮文库扩增只使用针对不同TCR亚基的一个引物对扩增。构建的文库添加了index序列可用于Illumina®测序平台测序。
试剂采用了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)技术和LNA技术，可以无偏扩增TCR mRNA序列，并具有很高的灵敏度。
 
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
图1. SMARTer 法文库构建流程及TCR多样性分析PCR策略
 
 
Technote：
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产品详情请点击：SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
 
 

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SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634402 SMARTer® Mouse TCR a/b Profiling Kit 12 Rxns ￥12,665 SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
Clontech 634403 SMARTer® Mouse TCR a/b Profiling Kit 48 Rxns ￥39,921 SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
Clontech 634404 SMARTer® Mouse TCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥63,453 SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit—
获得TCR-α和β链 V(D)J可变区全长序列
· 完整的V(D)J序列信息—获得TCR mRNA转录本可变区的全长序列
· TCR-α和β链—同时或单独分析TCR两个亚基的多样性
· 无需多重PCR—每次反应利用一对引物扩增相应的TCR亚基
· Illumina-ready测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和index序列
 
SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit 为那些寻求对T细胞受体（TCR）库进行NGS分析的研究者提供了一种强大的新的解决方案。试剂基于5’-RACE 方法可以捕获TCR转录本完整V(D)J 可变区，可以低至10 ng 至500 ng的来源于小鼠脾脏、胸腺或PBMCs的总RNA起始，也可以1,000 至 10,000个纯化的T细胞起始。顾名思义，本试剂可以在同一实验或单独实验中获得α和β链链多样性数据。
与采用多重PCR方法研究TCR多样性不同，每轮文库扩增只使用针对不同TCR亚基的一对引物扩增，提高了效率，减少了引物二聚体形成的可能性。基于多重PCR的分析方法，众所周知容易形成与引物相关的序列特异性偏差；这些偏差在我们基于RACE的方法中不会存在，因为所有的可变区都由相同的恒定区序列引发。采用本试剂~4 h即可构建indexed文库用于Illumina平台测序。
试剂采用了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) 技术和LNA技术，可以无偏扩增TCR mRNA序列，并具有很高的灵敏度。
 
SMARTer Mouse TCR a/b Profiling Kit
图1. SMARTer 法文库构建流程及TCR多样性分析PCR策略
 
 
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SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634466 SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit 12 Rxns ￥14,567 SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
Clontech 634467 SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit 48 Rxns ￥42,305 SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
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SMARTer® Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
捕获人的BCR转录本完整V(D)J 可变区
· 起始样品量: 从外周血单核细胞（PBMC）纯化的10 ng-1μg的总RNA或从B细胞纯化的1-100 ng的总RNA
· 通过添加UMI，校正来自PCR错误、重复序列以及序列错误的读取
· cDNA文库构建经过优化，可以灵敏、特异地检测克隆型
· 可准确扩增并通过测序鉴别人IgG亚类
· 经过优化的PCR pooling策略，可以高灵敏度地从同一样品中检测不同链
· 灵活的pooling策略适用于不同的实验需求，以比对、识别原始链序列
· 可以使用Cogent NGS Immune Profiler Software进行序列数据分析的完整工作流程
 
新推出的SMARTer Human BCR IgG H/K/L Profiling Kit基于5’RACE和NGS技术，提供了一种灵敏，准确，优化的BCR库分析方法。通过5’RACE方法减少了变异性并且可以从BCR重链或轻链的恒定区引发扩增。该试剂盒将这些优点与基因特异性扩增相结合可以捕获BCR完整V(D)J可变区，提供了一种高灵敏度、可重复的B细胞库分析方法。
该试剂盒设计的可以从外周血单核细胞（PBMC）纯化的10 ng-1μg的总RNA或从B细胞纯化的1-100 ng的总RNA，生成Illumina文库。可以为人免疫球蛋白IgG和IgM的重链和轻链（κ和λ）生成数据。该试剂盒还包括特别的分子条形码（UMI），从而可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向，从而确保获得更准确和可靠的结果。
测序结束后，可以使用Takara Bio Immune Profiler Software分析数据，该软件使用基于UMI的纠错功能，并可以使用MIGEC（Shugay，2014年）和MiXCR软件（Bolotin，2015年）。该软件支持高质量的BCR分析，包括克隆型计数和鉴别以及V(D)J区域的序列信息。
 
SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图1. SMARTer Human BCR IgG H/K/L Profiling Kit技术流程
 
Panel A 第一链cDNA合成由dT引物（RT引物）起始，MMLV衍生的SMARTScribe反转录酶会在mRNA模板5’末端添加几个非模板核苷酸。SMART UMI Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板，通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列（也就是模板转换步骤）。然后第一链cDNA经过两轮基因特异性的PCR扩增（详见Panel B）。第二轮的巢式PCR扩增可以确保绝大多数的reads比对到B细胞受体的转录本上。
 
Panel B 第一轮PCR以第一链cDNA为模板，引物包括与Illumina Read Primer 2序列互补的正向引物（PCR1 Universal Forward primer），以及与BCR重链或轻链恒定区互补的反向引物（PCR1 IgG/IgM/IgK/IgL Reverse primers）。以Read Primer 2序列和恒定区起始，第一轮PCR特异性扩增了BCR重链或轻链cDNA的完整可变区及部分恒定区。第二轮PCR以第一轮PCR的产物为模板，采用半巢式引物（PCR2 IgG/IgM/IgK/IgL Reverse primers）扩增BCR重链或轻链的cDNA的完整可变区及部分恒定区。
 
SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图2. 从1-100 ng B细胞RNA中鉴定出的克隆型信号
 
从1 ng，10 ng和100 ng人CD19 + B细胞总RNA中，利用本试剂盒制备BCR分析IgG，IgM，IgK和IgL文库。为了进行分析，对于1 ng，10 ng和100 ng的RNA起始，分别将文库down-sampling至100,000个，400,000个和5,000,000个reads，然后利用Takara Bio Immune Profiler Software处理。
 
SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图3. 散点图展示了用1μg PBMC RNA生成的文库之间的一致性
 
以来自健康供体的1μg PBMC RNA起始，一式两份制备IgG，IgM，IgK和IgL文库。通过down-sampling至1300万次读取来分析该文库。该图包括来自技术重复的所有四个文库（IgG，IgM，IgK和IgL）。
 
SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图4. 来自不同供体的PBMC RNA的克隆型计数
 
对来自8个供体的10 ng PBMC RNA（不同颜色代表不同供体），分别使用SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit来鉴别IgG，IgM，IgK和IgL的克隆型。文库归一化为100,000 reads以进行分析。
 
SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
图5. 10 ng PBMC RNA文库的测序饱和度评估
 
以来自单个供体的10 ng PBMC RNA起始，使用SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Kit制备BCR分析文库。
 
Panel A 显示了不同测序深度的IgG克隆型计数，其中蓝线和紫线分别是指经过UMI修正误差和没有经过UMI修正误差的数据。IgG和其他链（IgM，IgK和IgL未在图中展示）按每个文库150万个读数进行测序，然后通过down-sampling至1,000K，500K，200K，100K，50K，10K和5K reads。使用Takara Bio Immune Profiler Software分析不同测序深度的结果。
 
Panel B 维恩图显示了低测序深度（100K）和高测序深度（1,500K）的文库之间重叠的克隆型。
 
 
 
 
Technote：
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SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
SMARTer Human BCR：
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SMARTer Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit
 
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SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634422 SMARTer® Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit 12 Rxns ￥11,559 SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
Clontech 634423 SMARTer® Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit 48 Rxns ￥39,488 SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
Clontech 634424 SMARTer® Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit 96 Rxns ￥63,143 SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
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SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit—捕获BCR转录本完整V(D)J 可变区
· 起始样品量：10 ng-3 μg来自于脾脏、淋巴结、PBMCs 及杂交瘤的总RNA
· cDNA文库构建经过优化可以灵敏、特异地检测克隆型
· 在大多数情况下，可以准确扩增并通过测序鉴别小鼠IgG亚类
· 经过优化的PCR pooling策略，可以高灵敏度地从同一样品中检测不同链
· 灵活的pooling策略适用于不同的实验需求，以比对、识别原始链序列
 
 
B 细胞是适应性免疫应答的重要组成部分，其表面表达B细胞受体（BCR），可以识别病原体中的特定分子模式。了解BCRs图谱（也就是由特定H,K,L基因片段构成的受体和克隆型多样性）不仅有助于深入了解健康个体中的适应性免疫应答，也有助于了解多种疾病的适应性免疫应答。准确确定免疫系统表达的克隆型和同种型有助于全面了解B细胞群体。
 
新推出的SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit基于5’RACE和NGS技术，提供了一种灵敏，准确，优化的BCR库分析方法。虽然采用多重PCR可以在一个反应中对多个BCR基因进行扩增，但也被证明在对特定序列进行扩增时存在灵敏度，特异性和偏差的问题，这些都可能带来同种型的鉴别困难。而5’RACE方法减少了变异性并且可以从BCR重链或轻链的恒定区引发扩增。试剂盒将这些优点与基因特异性扩增相结合可以捕获BCR完整V(D)J可变区，提供了一种高灵敏度、可重复的B细胞库分析方法。在大部分情况下，通过H/K/L链的下游测序分析可以准确鉴别克隆型，可靠确定同种型。
 
SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
图1. BCR重排过程。
祖细胞发育过程中胚系基因片段经过V,D,J重排形成两条相同的重链。V,J片段重排形成两条相同的轻链。V,D,J片段连接处的核苷酸随机插入或缺失增加了额外的多样性。B细胞经过免疫应答刺激后通过体细胞高频突变（SHM）进一步引入更多的点突变。
 
SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
图2. SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit技术流程。
PanelA dT-引物起始合成一链cDNA，经过两轮PCR扩增合成cDNA文库。PCR产物经纯化，片段筛选和质量检测后用于测序分析。
PanelB对于每个样品，在样品中所有mRNA 进行RT反应后，使用者可以通过两轮基因特异性巢式PCR特定扩增IgG 的1-3条链。
 
SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
图3. PCR扩增及pooling流程。
对于每一个样品，在所有mRNA进行RT后，使用者可以特定扩增IgG的1-3条链。每个扩增反应需要5μl RT产物。第一轮PCR后，各取1μl PCR反应产物用于独立PCR反应，分别扩增每条链，同一样品添加相同的indexes，不同的样品添加不同的indexes。经过PCR 2最终扩增后，使用者可以通过Bioanalyzer 或Fragment Analyzer分析每个反应产物，可以以此选择哪条扩增链进行混合测序。
 
SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit
图4. 准确扩增所有5种IgG亚类。
以来自于不同IgG亚型的自有杂交瘤（10E8）和两个ATCC杂交瘤样品（HB-8117和TIB-127）的10 ng RNA起始，采用SMARTer Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit构建包含BCR重链和轻链（kappa）的文库。Panel A Bioanalyzer结果显示了每个杂交瘤重链和轻链的基因特异性扩增结果。在每个样品中都观察到了700-900 bp的预期峰值。电泳图中明显的峰表明在这些杂交瘤中表达kappa链。相反，lambda链测序库相对较宽并且大小低于预期。每个样品中标注为“LM”和“UM”的峰为DNA reference marker。Panel B 采用MiXCR软件（version 1.8）确定比对指标，与所有IG序列进行了比对分析。MiXCR软件对前2个克隆的分析结果显示了V,D,J等位基因及通过软件分析确定的同种型和亚类。
 
Technote：
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SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634431 SMARTer® Human scTCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥48,426 SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
Clontech 634432 SMARTer® Human scTCR a/b Profiling Kit 480 Rxns ￥149,865 SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit—
阐明单细胞中T细胞受体Alpha-Beta 链配对
· 工作流程灵活—可以利用FACS（流式细胞术）或手动分选细胞构建 Illumina测序文库
· 易于使用—优化的index允许将96个细胞混合制成12个文库，
   并可以进一步混合在一个flow-cell lane中测序
· 灵敏度高—基于RACE方法可以检测低丰度TCR变异体
· 特异性好—完整reads，大部分reads可以比对到目标区域，提供准确链配对信息
 
尽管批量T细胞测序有助于进一步了解T细胞受体库（TCR）多样性，但是批量测序不能确定T细胞群内特定的alpha-beta 受体链配对信息。由于特定的TCR alpha-beta链配对介导抗原特异性，获得配对信息对于深入了解抗原识别，靶向免疫治疗TCR的有效设计至关重要，也有助于确立T细胞群的祖先关系。单个T细胞测序可以确定特定细胞的配对信息，但是价格可能非常昂贵并涉及复杂的分析，因为大部分方法需要对大量的细胞测序。
 
使用SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit可以解决这些问题，在SMART cDNA Synthesis中通过采用一系列indexed oligo可以将手动或FACS分选的96个样品制成12个测序pool，并且这12个pool可以进一步混合，这样所有的96个样品可以在一个flow-cell lane 中测序。与用于大量样品测序的SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit 一样，试剂采用了SMART cDNA synthesis和RACE方法，通过进一步的TCR基因特异性PCR完整捕获和扩增TCR-alpha 和TCR-beta可变区构建Illumina测序文库，为TCR测序提供了一种高灵敏度的方法。
 
如果您需要软件对采用本试剂盒构建文库测序获得的数据进行demultiplex分析，请登录SMARTer Human scTCR Demultiplexer。
 
SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图1. 在单细胞水平进行T细胞研究的优势。
 
Panel A. T细胞受体alpha链 (TCR-α) 和beta链组成示意图。 Panel B. 示意了难以从批量细胞测序数据中获得alpha链 (TCR-α) 和beta链配对信息。针对稀有克隆型可以分析部分细胞中的配对信息（橙色克隆型），但是对于高表达的克隆型(TCRA V2J1, TCRA V2J2, TCRB V3D1J1, TCRB V2D1J2)可能有4种配对组合。
 
SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图2. SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit技术流程及pooling策略。
 
Panel A. 第一链cDNA合成由dT引物（RT引物）起始，MMLV型逆转录酶（RT）会在mRNA 5’端添加几个非模板核苷酸。SMART-Seq Indexed Oligos与这几个非模板核苷酸互补结合作为模板，通过RT在第一链cDNA末端添加额外核苷酸序列（也就是模板转换步骤）。试剂盒中提供8种不同的SMART-Seq Indexed Oligo，每一个SMART-Seq Indexed Oligo中内嵌唯一的六碱基index作为细胞barcode，用于下游pooling细胞的识别。通过RT添加到cDNA末端的额外序列-被称为“SMART sequence”-作为接下来几轮PCR扩增的引物结合位点，确保只有来自于全长cDNA的序列才能被扩增。经过pool（Panel B所示）和纯化后，通过连续两轮基因特异性PCR扩增来自于TCR-α 和/或 TCR-β可变区的cDNA序列。第一轮PCR采用扩增过的双链cDNA为模板，正向引物与SMART sequence互补，同时包含Illumina Read 2序列（TCR Primer 1），反向引物与TCR-α和TCR-β的恒定区（即不变区）互补（TCR a/b Human Primer 1）。第二轮PCR以第一轮PCR产物为模板，采用的正向引物与第一轮PCR添加的Read 2 序列互补。反向引物与恒定区结合，位于PCR1 primers内侧 (TCR a/b Human Primer 2 Reverse HT Index)，扩增TCR-α和TCR-β cDNA的完整可变区及部分恒定区。正向引物和反向引物包含适用于Illumina测序平台的接头序列和index，可以将多达96个样品混合用于在一个flow-cell lane中测序。Panel B. 按列混合样品，这样每个pool中包含8个细胞，每个细胞带有不同index的SMART-Seq Indexed Oligo 。在PCR 2中通过正向和反向HT indexes的不同组合使用，可以将多样品进一步混合在一个flow-cell lane 中测序（更多信息参见User Manual）。
 
SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
图3. 96孔板中混合细胞群的分析。
 
Panel A. 基于鉴别每孔的克隆型确定细胞种类。遗漏的7个细胞没能通过对高于阈值的TCR-α 或TCR-β的reads数分析确定克隆型。Panel B. 配对信息分析。分析获得了平板中34个细胞的TCR-αβ配对克隆型。Panel C. 以百分比展示了分析细胞的alpha，beta，或alpha-beta配对信息。遗漏的细胞没有包括在分析数据中。
 
 
Technote：
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产品详情请点击：SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit
 
 
视频资料：在单细胞水平对人T细胞受体库分析的解决方案
Takara Bio USA公司Dr. Ankita Das和Dr. Sarah Taylor探讨可以实现分析每个细胞中的TCRα和TCRβ链的可变区全长序列，构建测序文库的SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit。
 

页面更新：2021-09-26 14:43:04

cDNA合成SMARTer试剂酶试剂盒Takara

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cDNA合成SMARTer试剂
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 634925 SMARTer PCR cDNA Synthesis Kit 10 Rxns ￥9,500
￥7,600 		cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂
Clontech 634926 SMARTer PCR cDNA Synthesis Kit 20 Rxns ￥16,047
￥12,838 		cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂
Clontech 634928 SMARTer Pico PCR cDNA Synthesis Kit 10 Rxns ￥14,446 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂 cDNA合成SMARTer试剂

*红字为促销价格，促销时间: 2022年9月1日-2022年10月31日

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Code No. 产品名称
634925   SMARTer® PCR cDNA Synthesis Kit
634926   SMARTer® PCR cDNA Synthesis Kit
634928   SMARTer® Pico PCR cDNA Synthesis Kit
 
SMART即RNA模板5’末端的转换机制，该技术在cDNA第一链合成的过程中，巧妙且高效地将一段已知序列加入到合成的cDNA两端，不需要adaptor连接。这段已知序列的存在对于下游应用包括扩增、RACE和文库构建等很关键。通过多种技术来利用这些已知序列的同时，一步法SMART技术的简便性和高效性保证了很高的灵敏度，并生成和扩增全长cDNA。
 
微量的RNA样本操作
整个SMART流程是在一个tube中的单酶反应。仅需对珍贵的RNA样本做很少的处理，可有效降低潜在的降解风险。这个用户友好型的流程是简单直接的，无需adaptor连接、加尾、中间过程纯化等操作。
 
全长cDNA富集
由于cDNA合成容易受到模板RNA二级结构的影响，传统方法合成的cDNA，基因5’端通常未能全部存在保留。而SMART cDNA合成过程中，由于反转录提前终止而生成的缩短了的产物，无法与SMARTer oligonucleotide结合的，在PCR过程中无法被扩增。所以，使用SMART技术结合长距离PCR合成扩增的cDNA，是被富集的全长cDNA。此外，由于5′ SMARTer序列和修饰的oligo dT引物不会添加到基因组DNA和核糖体RNA转录的cDNA上，所以SMART技术合成的cDNA是不含有这些污染因素的。
 
高灵敏度、高效率
与传统的方法如adaptor连接方法相比，SMART技术优势之一，就是其具有更高的效率。SMART技术高效率和高灵敏度的特点，使SMART技术尤其适用于起始材料有限的情况，如显微切割组织、激光捕获细胞、活组织切片样本等。低至1-2 ng的total RNA已足够生成高度代表性的cDNA库用于各种下游应用。
 
单步操作
SMARTer 第一链cDNA合成过程中，已知通用引物序列已经添加到了cDNA两端。第一链合成后，SMARTer cDNA可以直接用于下游PCR应用。
 
■ 特点
·total RNA起始量可以低至1-2 ng
·特异性富集全长cDNA
·优化的流程以保留真实的基因表达
·简单的操作，无需DNase处理或单独的adaptor连接步骤
 
产品详情请点击：cDNA合成SMARTer试剂
 
 
 

页面更新：2019-11-05 11:12:35

SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit酶试剂盒Takara

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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
品牌 Code No. 产品名称 包装量 价格（元） 说明书 数量
Clontech 635016 SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit 96 Rxns ￥61,300 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
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SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit—
获得TCR-α和TCR-β链V(D)J可变区全长序列
· 完整的 V(D)J序列信息—获得TCR mRNA转录本可变区全长序列
· TCR-alpha 和 TCR-beta—分析TCR2个亚基的多样性，无论是同一实验还是单独实验
· 起始样品灵活—可以10 ng-3 μg 外周血RNA或50-10,000个纯化T细胞起始
· 无需多重PCR—每次反应利用一对引物扩增相应的TCR亚基
· Illumina-ready 测序文库—无需接头连接即可添加Illumina接头和index序列
· 灵敏度高—即使是测序深度很低的情况下也可检测低丰度TCR序列
· 出色的重复性—在不同起始量情况下可以获得一致性很好的结果
 
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit给需要开展T细胞受体（TCR）NGS分析的研究者提供了一种新的强大的解决方案。试剂盒采用类似于5’RACE的方法，可以人血液RNA(10 ng-3 μg)或完整淋巴细胞(50-10,000 个纯化T细胞)起始，捕获TCR V(D)J完整可变区域。顾名思义，本试剂可以在同一实验或单独实验中获得TCR-alpha和TCR-beta链多样性数据。与采用多重PCR方法研究TCR多样性不同，每轮文库扩增只使用针对不同TCR亚基的一个引物对扩增。构建的文库添加了index序列可用于Illumina®测序平台测序。
试剂采用了SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template)技术和LNA技术，可以无偏扩增TCR mRNA序列，并具有很高的灵敏度。
 
SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
图1. SMARTer 法文库构建流程及TCR多样性分析PCR策略
 
 
Technote：
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点击图片下载		 SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
 
产品详情请点击：SMARTer Human TCR a/b Profiling Kit
 
 

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