SARS-CoV-2 N del31-33 Mutation Detection Kit
SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒
本产品是一步法RT-qPCR检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron毒株(B.1.1.529)中N区存在的特征性突变del31-33的试剂盒。del31-33 是指N区第31~33位中E、R 和 S三个氨基酸缺失的突变。Omicron毒株是在南非首次发现的变异株,在刺突蛋白中含有30多个突变。它比传统的变异株具有更高的传染性,因而被世界卫生组织(WHO)列为“关切变异株”(Variant of Concern;VOC)。
本产品针对的是突变位点少的N区突变,并非突变位点多的S区。因此引物探针不会与其他突变位点产生反应、干扰测试,即可特异性、高灵敏度检测Omicron。
经证实,本产品不与Alpha变异株、Beta变异株、Gamma变异株产生反应,只与Omicron毒株产生特异性反应。
SARS-CoV-2 N del31-33 突变检测试剂盒【281-37703】
◆试剂盒组成
20 Reactions
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RT 酶混合物(20×)
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20 μL×1
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一步反应混合物(2×)
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200 μL×1
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野生型引物&探针混合物 (Wild Type Primer & Probe Mixture)
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10 μL×1
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N del31-33突变型引物&探针混合物 (N del31-33 Mutant Type Primer & Probe Mixture)
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10 μL×1
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◆特点
● 容易判断
● 使用突变型和传统型的引物/探针套装时,可通过比较Ct值进行判断
● 一步法RT-qPCR法快速检测突变
● 约70 min 即可完成
● 使用独立研发的引物探针进行高灵敏突变检测
● 当与其他突变体检测试剂盒组合使用时,所有变异株均可于同一反应条件下在1块96孔板上进行检测
● N501Y、E484K、L452R、E484Q、del247-253、N del31-33试剂盒的所有PCR反应条件相同,因此可在
● 1块96孔板上进行检测
◆检测原理
采用TaqMan® 探针的1-step RT-qPCR。
▼使用前 在病毒RNA量多的情况下,使用传统(非突变)型检测用的Wild Type Primer / Probe,也能在变异株中观察到扩增信号。请务必使用传统
(非突变)型检测用的Wild Type Primer/Probe 和突变型检测用的Mutant Type Primer/Probe两种进行检测。比较两种Ct值,若突变型检
测用Mutant Type Primer/Probe的Ct值较小,则判断该病毒为变异株。
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◆实验案例
变异株检测的应用数据
用以下5种新型冠状病毒株的纯化RNA对本试剂盒进行测试:
● Omicron毒株(B.1.1.529):TY38-873P1,由日本国立传染病研究所提供
● alpha毒株(B.1.1.7):QHN001,N501Y突变,由日本国立传染病研究所提供
● Beta毒株(B.1.351):TY8-612,N501Y突变,E484K突变,由日本国立传染病研究所提供
● gamma毒株(P.1):TY7-501,N501Y突变,E484K突变,由日本国立传染病研究所提供
● 传统毒株(VR-1986HK):从ATCC购买的热灭活新型冠状病毒株
样本拷贝数:5000拷贝/孔
循环数:45
① Omicron株(B.1.1.529):TY38-873P1
Omicron毒株在N区含有del31-33突变,因此N del31-33 Mutant type Primer / Prob的扩增曲线(红色)比Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)更早起峰。
② alpha株(B.1.1.7):QHN001
alpha毒株在N区中不含del31-33突变,因此Wild type Primer / Probe(蓝色)的扩增曲线比 N del31-33 Mutant type Primer / Probe(红色)的扩增曲线更早起峰。虽然alpha毒株与Omicron毒株均含有N501Y突变,但经确认本产品不与alpha毒株产生反应。
③ Beta株(B.1.351):TY8-612
Beta毒株在N区中不含有del31-33突变,因此Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)更早起峰。虽然Beta毒株与Omicron毒株均含有N501Y突变,但经确认本产品不与Beta毒株产生反应。
④ gamma毒株(P.1):TY7-501
gamma毒株在N区中不含del31-33,因此Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线更早起峰。虽然gamma毒株与Omicron毒株均有N501Y突变,但经确认本产品不与gamma毒株产生反应。
⑤ 传统毒株(VR-1986HK):从ATCC购买的热灭活新型冠状病毒株
传统毒株在N区中不含del31-33突变,因此Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)更早起峰。
对照RNA的检测数据
使用本试剂盒测定合成Omicron菌株的对照ssRNA。
在不含N del31-33突变的对照ssRNA(Wild Type Control RNA)中,Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)比N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)更早起峰。
在含N del31-33突变的对照ssRNA(N del31-33 Mutant Type Control RNA)中,N del31-33 Mutant type Primer / Probe的扩增曲线(红色)比Wild type Primer / Probe的扩增曲线(蓝色)更早起峰。
PCR反应条件
将板置于qPCR仪板,按以下流程设定。
◆变异株一览表
变异株
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N501Y突变
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E484K突变
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L452R突变
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E484Q突变
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del247-253突变
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N del31-33突变
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传统毒株
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Alpha毒株 (B.1.1.7)
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+
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Beta毒株 (B.1.351)
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+
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+
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Gamma毒株 (P.1)
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+
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+
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Epsilon毒株(B.1.427/B.1.429)
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Kappa毒株(B.1.617.1)
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+
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+
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Delta毒株 (B.1.617.2)
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+
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Lambda毒株 (C.37)
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+
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Omicron毒株(B.1.1.529)
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+
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-※
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※含E484A突变
※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。